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| 海洋三所获奖清单（主持） | ||||
| 年份 | 序号 | 奖项 | 成果名称 | |
| 2001 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 特定海域和海岸多平台多传感器遥感综合应用研究 |
| 2002 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 海洋生物质量标准制订 |
| 2 | 二等奖 | 重组鱼促长素酵母添加剂 | ||
| 2003 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 高纯河豚毒素（TTX）开发中试研究 |
| 2 | 厦门市科技进步奖 | 三等奖 | ||
| 3 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 海洋药源生物资源及基因库的构建 | |
| 2004 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 对虾病毒PCR快速检测试剂盒 |
| 2 | 国家海洋局优秀图书 | 海洋生物基因工程实验指南 | ||
| 3 | 厦门市科学技术奖 | 三等奖 | 大黄鱼性早熟防治技术研究 | |
| 2005 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 海水养殖病害病原检测及防治的开发研究 |
| 2 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 福建惠安核电厂附近海域海洋生物及其生态环境调查和观测 | |
| 3 | 福建省科技进步奖 | 三等奖 | 海水养殖病害病原检测及防治的开发研究—对虾和大黄鱼等于类主要病原检测及防治的开发研究 | |
| 4 | 厦门市科技进步奖 | 三等奖 | 葡糖胺硫酸盐提取与精制工艺研究 | |
| 5 | 厦门市科技进步奖 | 三等奖 | 厦门海环境监测与预警预报调查研究 | |
| 2006 | 1 | 海洋创新成果奖 | 一等奖 | 对虾抗病相关基因的功能研究 |
| 2 | 二等奖 | 海洋微生物几丁质酶的研究与开发 | ||
| 3 | 福建省科学技术奖 | 三等奖 | 无公害健康海水养殖技术与产业化示范 | |
| 4 | 优秀海洋科技图书奖 | 厦门湾物种多样性 | ||
| 2007 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 对虾白斑综合症病毒结构蛋白研究 |
| 2 | 厦门市科技进步奖 | 二等奖 | 厦门西海域整治和开发相关的水动力环境数值模拟 | |
| 2008 | 1 | 海洋创新成果奖 | 一等奖 | 深海嗜热细菌及噬菌体的分子生物学研究 |
| 2 | 二等奖 | 福建罗源湾环境容量与海洋生态保护规划研究 | ||
| 3 | 二等奖 | 海洋生物药源“高纯葡糖胺硫酸盐”规模产业工程化研究 | ||
| 4 | 二等奖 | 核电站海洋环境影响评价技术研究与实践—以宁德核电围填海工程环境影响评价为例 | ||
| 2009 | 1 | 海洋创新成果奖 | 二等奖 | 高频地波雷达系统海上对比观测分析方法研究——以福建示范区为例 |
| 2 | 二等奖 | 海洋环境中POPs_重金属复合污染评价指标的初步建立研究 | ||
| 3 | 二等奖 | 深海与极地中PAHs降解菌及降解基因多样性研究 | ||
| 4 | 二等奖 | 船载海——气CO2观测系统的升级改造研究 | ||
| 2010 | 1 | 海洋创新成果奖 | 一等奖 | 大黄鱼免疫的分子基础及重要免疫基因的功能研究 |
| 2 | 一等奖 | 华南海滩动力地貌研究与应用 | ||
| 3 | 二等奖 | 南极区域保护与管理研究 | ||
| 4 | 二等奖 | 中国长江以南近岸海域甲藻孢囊分类学及生态学研究 | ||
| 2011 | 1 | 海洋创新成果奖 | 一等奖 | 气候变化对中国台湾海峡及其邻近海域海洋生态系统的作用（908） |
| 2 | 二等奖 | 中国海及邻近西北太平洋海洋生物物种编目和分布图集编制 | ||
| 3 | 二等奖 | 海洋生物毒素标准技术与标准样品研究开发 | ||
| 4 | 二等奖 | 海洋生物毒素解毒剂药物的设计合成及活性筛选 | ||
| 5 | 海洋工程科学技术奖 | 二等奖 | 北冰洋海洋碳循环观测工程技术及其应用研究 | |
| 2012 | 1 | 海洋科学技术奖 | 二等奖 | 基于海岸带综合管理的海洋生物多样性保护研究与示范 |
| 2 | 二等奖 | 中国海洋生物种类名录和图谱 | ||
| 3 | 二等奖 | 核电海域放射性检测新技术与辐射防护评价 | ||
| 4 | 优秀海洋科技图书 | 《中国海洋物种和图集》 | ||
| 5 | 海洋工程科学技术奖 | 一等奖 | 海洋微生物资源采集与国家海洋微生物资源共享平台建设 | |
| 6 | 二等奖 | 海洋生物毒素“替曲朵辛”原料药产业化关键工程技术研发与应用 | ||
| 2013 | 1 | 海洋科学技术奖 | 二等奖 | 我国近海海底地形地貌调查研究 |
| 2 | 海洋优秀科技图书 | 福建省海洋资源与环境现状 | ||
| 3 | 福建省科学技术奖 | 自然科学奖 二等奖 | 北冰洋碳循环及其对气候变化的响应 | |
| 4 | 厦门市科学技术奖 | 科技创新杰出人才奖 | ||
| 2014 | 1 | 海洋科学技术奖 | 二等奖 | 东北印度洋海洋多尺度变率及其气候效应研究 |
| 2015 | 1 | 海洋科学技术奖 | 二等奖 | 我国近海沉积物中的甲藻包囊分类及应用研究 |
| 2 | 海洋工程科学技术奖 | 一等奖 | 极区大气气溶胶和温室气体本底特征及其环境和气候效应研究 | |
| 3 | 海洋工程科学技术奖 | 二等奖 | 深海浸矿微生物的代谢分子基础及硫化矿浸出机理研究 | |
| 4 | 厦门市科学技术奖 | 三等奖 | 厦门市海岛地名普查 | |
| 5 | 测绘科技进步奖 | 二等奖 | 中国近海地形地貌成果集成 | |
| 2016 | 1 | 海洋科学技术奖 | 一等奖 | 海洋烷烃降解菌与代谢机制研究 |
| 2 | 海洋优秀科技图书 | 中国海滩养护技术手册 | ||
| 3 | 海洋工程科学技术奖 | 二等奖 | 流域-河口生态安全评价与生态系统管理研究 | |
| 2017 | 1 | 海洋工程科学技术奖 | 特等奖 | 中国海滩修复养护技术与应用 |
| 2 | 厦门市科技奖 | 二等奖 | 福建近海游泳动物多样性及其应用研究 | |
| 3 | 海洋优秀科技图书 | 北极快速变化与海洋生态系统响应 | ||
| 2018 | 1 | 海洋工程科技奖 | 特等奖 | 北冰洋快速酸化过程、机制及预测研究 |
| 2 | 海洋科技奖 | 一等奖 | 重点海域**工程 | |
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