中法深海微生物联合实验室（SINO-FRENCH LABORATORY OF DEEP-SEA MICROBIOLOGY -MICROBSEA）成立于2018年11月28日，由自然资源部第三海洋研究所与法国科学研究中心、法国海洋研究开发院和法国西布列塔尼大学联合共建。首期共建时间为2018年-2021年，具体执行部门为自然资源部第三海洋研究所生物遗传重点实验室与法国深海极端微生物实验室。实验室主要包括5个研究方向：基于应用宏基因组学的未培养微生物代谢机制研究；超嗜热、嗜压等难培养极端微生物的培养；深海病毒研究；深海微生物生态功能及生物地球化学循环贡献研究；深海微生物极端环境适应性的分子机制研究等。“中法深海微生物联合实验室”的建立是我国深海生物学研究的一个重要里程碑，有助于进一步推动我国深海生命科学相关学科的建设与人才培养，使我国在该领域到达国际领先地位，并有力促进深海基因资源开发利用。