自然资源部第三海洋研究所承担的中国-东盟海上合作基金“全球变化背景下南中国海近海生态系统监测与保护管理示范”项目自实施以来取得了一系列重要进展，特别是在南海珊瑚礁生态系统的研究中发现了底栖甲藻的2个新属，5个新种，发现珊瑚礁鱼类新记录种6种，识别泰国湾大型海洋珍稀物种和生态系统保护的关键优先区，发表SCI收录论文23篇，出版马来西亚首部珊瑚礁鱼类生态图谱专著1部，申请发明专利2项。

该项目于2017年底获外交部批准立项，在东盟9个国家开展典型生态系统、海洋环境污染和大型哺乳动物的联合调查，在此基础上进行典型生态系统健康状况的评价，开展南海近海生态系统综合管理合作。

项目启动以来海洋三所和马来西亚登嘉楼大学、思特雅大学、菲律宾大学、越南海洋研究所签订了合作备忘录，在泰国、马来西亚、新加坡、菲律宾、印度尼西亚等东盟国家开展了10余次联合调查，涉及科研人员100多人次，主要进展和成果如下：

1.海洋环境污染

（1）富营养化评价：发现南海局部海域存在富营养化现象。建立了一种基于无机氮、无机磷和溶解氧的富营养化评价新方法，评价结果显示北部湾、泰国湾和印尼龙目岛海域的水质状况良好，而柔佛海峡和马尼拉湾均有一些站位存在程度不同的富营养化，富营养化导致硅藻暴发，是低氧形成的主要原因。该成果作为典型案例研究入选地球大数据支撑可持续发展目标报告（2020）。

（2）海洋酸化：自主研发海水溶解无机碳DIC在线观测系统并在泰国和马来西亚开展应用。发现登嘉楼河口水体DIC与潮汐变化具有很好的一致性，表明高潮位时河口水体混合较充分，而在低潮位时，水体分层现象明显。该研究成果发表在Journal of Marine Science and Engineering。

2.典型生态系统

（1）珊瑚礁生态系统：

珊瑚礁：发现造礁珊瑚响应高温胁迫的一种生态适应机制。造礁珊瑚能通过虫黄藻系群的变化响应高温胁迫，首次发现造礁珊瑚生长对钙离子的需求具有种的特异性；自主开发设计的海洋酸化模拟控制系统在马来西亚登嘉楼大学开展了合作应用与合作研究，发现酸化引起pH下降对造礁珊瑚钙化以及骨骼微形态产生显著的影响。系列成果发表在Aquaculture、Frontier in Marine Science等国际期刊上。

底栖甲藻：发现底栖甲藻的新分类单元，包括2个新属和5个新种。在南海珊瑚礁区域发现了2个新属—卡拉多藻属（Caladoa）和约翰藻属（Johsia），5个新种，包括阿卡雄卡拉多藻（Caladoa arcachonensis）、马来原甲藻（Prorocentrum malayense）、马来刺角藻（Ceratocorys malayensis）、游氏五角藻（Pentaplacodinium usupianum），春蓬约翰藻（Johsia chumphonensis）等，其中的2个新属在印度尼西亚、泰国湾、中国海南都有分布，证明了南海海洋生物分布的连通性，成果发表在European Journal of Phycology, Harmful Algae等期刊。

珊瑚礁鱼类：发现珊瑚礁鱼类新记录种和生物地理分布新信息。发现马来西亚珊瑚礁鱼类新记录种6种，并揭示了珊瑚三角区生态系统内部联系复杂程度高、成熟度高和系统状态稳定的特点，成果发表在Estuarine, Coastal and Shelf Science等期刊。出版英文专著《Common Reef Fish of Terengganu, Malaysia》，较完整记录了马来西亚珊瑚礁鱼类的种类与分布，为当地珊瑚礁鱼类的保护和管理提供了科学依据。

（2）红树林生态系统：发现红树林生态修复后固碳能力的恢复特征。梳理了全球范围内修复的红树林的碳储量，估算出在红树植被达到成熟状态前每公顷红树林每年的固碳能力达到6.7吨碳。发现高位养殖活动中排放清塘废水将造成滨海湿地土壤温室气体氧化亚氮的剧烈排放，造成增温效应并削弱红树林的固碳功能。研究成果发表在Environmental Reseach Letters, Science of the Total Environment等刊物。

（3）海洋生态连通性：发现海草床通过多样化的微生境为邻近珊瑚礁提供多重裨益。通过原位潜水摄影揭示了海草床中微生境的多样性，并阐述了礁栖生物是如何利用这些多样化的微生境，为海草床和珊瑚礁之间的宏观生态连通性提供支持。成果作为封面文章发表在Ecosystem Health and Sustainability期刊，并被推荐到海洋强国等，累计点击量近50万。

3.大型海洋珍稀动物

识别泰国湾大型海洋珍稀物种保护优先区，为保护和管理提供了科学依据。 基于收集的中华白海豚、伊洛瓦底海豚及海龟分布资料，通过物种分布模型界定了三个物种在整个泰国湾的分布格局、潜在分布区和关键核心栖息地。基于生态系统整体保护的理念，分别以中华白海豚、伊洛瓦底海豚及海龟为“代理物种”，分析了这三个物种的关键栖息地保护对其他海洋生物多样性/生态系统（海龟产卵场、海草床、珊瑚礁等）的保护效果，发现中华白海豚栖息地能提供最优的保护效果，进而开展了泰国湾沿海生物多样性保护优先区选划，共识别出5个大型海洋珍稀物种保护和生态系统保护的关键优先区，成果发表在Diversity and Distributions。