科技部项目：

1、 中美海洋碳循环研究和海水加铁试验技术（2009-2012）

2、 深海微生物多样性与基因资源调查关键技术（2010-2013）

3、 东南亚珊瑚生态系统评价与生物活性物质发现（2015-2018）

4、 极区海洋酸化监测与评估（2015-2018）

5、  南极海冰覆盖区氧化亚氮及氮循环研究（2017-2019）

6、  西太平洋海洋技术应用推广试验区建设（2017-2020）

中印尼海上合作基金项目：

1、 中印尼海洋与气候中心及联合观测站（2014-2017，参与）

中国-东盟海上合作基金项目：

1、北部湾海洋和岛屿环境管理合作研究（2015-2018）

2、 中国-东盟濒危海洋物种合作研究（2016-2018，参与）

3、 中国东盟海洋合作中心-中国-东盟海洋公园生态服务平台建设（2016-2018）

4、 全球变化背景下南中国海近海生态系统监测与保护管理示范（2018-2020）

5、 中国-东海洋生物廊道建设（2019-2020，参与）

亚洲区域专项资金项目：

1、 APEC区域处理海洋垃圾问题中国示范区行动（2016）

2、 中东盟海洋酸化观测培训研讨会（2016）

3、 中国与南亚国家海洋领域合作研究（2017）

4、 中国与东盟国家海洋酸化观测技术示范与推广（2018）

APEC中国基金项目：

1、 APEC蓝色经济示范项目中国示范区战略行动框架（2015）

2、 基于渔业减损的水产加工废弃物高值化利用中国实践与推广（2017-2018）

3、 APEC海洋垃圾防治政策对话论坛（2017）

4、 APEC海洋生态养殖确保粮食安全培训研讨班（2018）

IAEA/RCA项目：

1、  核能利用对亚太区域海洋环境影响评估基准研究     RAS/7/016 （2009-2011）

2、 区域水平核与同位素技术在海洋污染管理中的协同应用   RAS/7/019（2009-2011）

3、 福岛放射性释放对亚太区域海洋潜在影响的基准研究   RAS/7/021（2011-2015）

4、 支持可持续海洋生态系统管理中对气候变化评估时的核与同位素技术应用 RAS/7/024（2012-2015） 

中法合作项目：

1、 印度洋、南大西洋和东太平洋深海沉积物和热液口微生物多样性（2013-2015）

2、 宏基因组学、单细胞基因组学和创新培养方法，能够从深海热液口培养尚未培养的微生物和相关病毒，作为新生物分子/活性物   的储库（2015-2017）

3、 高压环境中（超）嗜热微生物资源挖掘及其特殊生理机制研究（2014-2016）